RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 TSPAN12O95859 305 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TFP02787 698 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HSD3B1P14060 373 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GPX2P18283 190 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PSMB5P28074 263 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SHC1P29353 583 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PSMB10P40306 273 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SP3Q02447 781 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CCDC157Q569K6 752 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SYT9Q86SS6 491 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 FANK1Q8TC84 345 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TM9SF4Q92544 642 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMEM202A6NGA9 273 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRNPP04156 253 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ACRP10323 421 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SRCP12931 536 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GALEQ14376 348 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF480Q8WV37 535 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 IL36AQ9UHA7 158 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRKYO43930 277 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PDGFAP04085 211 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRKCAP17252 672 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 BEX5Q5H9J7 111 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MANEALQ5VSG8 457 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MAP6Q96JE9 813 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CALML5Q9NZT1 146 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLX4Q8IY92 1834 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LEFTY2O00292 366 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MAS1P04201 325 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PITPNBP48739 271 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DEFB134Q4QY38 66 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GALNT7Q86SF2 657 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NUP43Q8NFH3 380 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ALG8Q9BVK2 526 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.86□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 A0A0G2JMP0 313 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 A0A0X1KG70 313 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC19A2O60779 497 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RAB3BP20337 219 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GRK5P34947 590 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 UGT2B10P36537 528 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SP140Q13342 867 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NATD1Q8N6N6 113 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GLTPQ9NZD2 209 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CACNG2Q9Y698 323 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CKAP5Q14008 2032 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RP2O75695 350 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SCG5P05408 212 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SYPP08247 313 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ACADMP11310 421 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NDUFV2P19404 249 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 FXYD6P3P58550 94 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CCNJQ5T5M9 372 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RPTNQ6XPR3 784 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GJD3Q8N144 294 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms