RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a1O08966 556 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgfb1P04202 390 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DctP29812 517 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp5a1Q03265 553 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msto1Q2YDW2 556 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb43Q30KM9 69 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uap1l1Q3TW96 507 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccser2Q3UHI0 833 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnrip1Q5M8N0 164 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atg4bQ8BGE6 393 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb46Q8BID6 600 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PigzQ8BTP0 560 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galnt18Q8K1B9 622 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TapbplQ8VD31 451 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ash2lQ91X20 623 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd300cA2A7V7 229 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm595A2AF73 655 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700080E11RikE9Q9G1 206 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtnd1P03888 318 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmprss9P69525 1065 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifa1P97361 278 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Otub1Q7TQI3 271 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mup21Q80YX8 181 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AntxrlQ8BVM2 641 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gprin3Q8BWS5 763 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atat1Q8K341 421 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bloc1s5Q8R015 185 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbgt1Q8VI38 347 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q99LU8 229 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smurf1Q9CUN6 731 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem179bQ9CY24 219 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Izumo2Q9DA16 220 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pbld1Q9DCG6 288 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17190V9GX38 357 aa19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actl10A2AKE7 346 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox2fA2ANE0 191 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Maml2F6U238 1170 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl9F7BE40 171 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EmdO08579 259 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fpr-s1O08790 351 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtx2O88441 263 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf1aP97357 453 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fzd3Q61086 666 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn7Q8BUM3 359 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Banf2Q8BVR0 90 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep68Q8C0D9 733 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dclk1Q9JLM8 756 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plag1Q9QYE0 499 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgs6Q9Z2H2 472 aa19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgm2A2CEK3 580 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxb3P09026 433 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp37P17141 594 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttf1Q62187 859 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf516Q7TSH3 1157 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgr15lQ80T54 456 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NanogQ80Z64 305 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a15Q8BG16 729 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ablim2Q8BL65 612 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mblac1Q8BWY4 260 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zhx3Q8C0Q2 951 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dusp7Q91Z46 422 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3bp4Q921I6 962 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aloxe3Q9WV07 711 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Creb3l1Q9Z125 519 aa19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgm7A2ART8 616 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spats1A2RRY8 269 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8374L7N2A9 172 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Capns1O88456 269 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl6O88848 186 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxc11P31313 304 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TstP52196 297 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CrtamQ149L7 389 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnk9Q3LS21 402 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 E330014E10RikQ3UL33 481 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D5Ertd577eQ499F0 481 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PmlQ60953 885 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt8Q64676 541 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tas2r13Q7M720 305 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd6Q8CBH5 775 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms