RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 NUDT13Q86X67 352 aa20.18■□□□□ 0.82
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SGMS1-210ENST00000619438 MAL2Q969L2 176 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-210ENST00000619438 MPP4Q96JB8 637 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-210ENST00000619438 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-210ENST00000619438 REEP1Q9H902 201 aa20.18■□□□□ 0.82
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC159P0C7I6 412 aa20.15■□□□□ 0.82
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SGMS1-210ENST00000619438 SPTBP11277 2137 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-210ENST00000619438 M0QX08 132 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 PDPK1O15530 556 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 DCKP27707 260 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 TUBA3CQ13748 450 aa20.14■□□□□ 0.81
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