RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524843.5

CASP4-204, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 2

Gene CASP4, Length 978 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-204ENST00000524843 ALDH4A1P30038 563 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FMO3P31513 532 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 XKP51811 444 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CRISP1P54107 249 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PRKAG1P54619 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CASP9P55211 416 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 OLR1P78380 273 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ST3GAL3Q11203 375 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ILKQ13418 452 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 RUNX2Q13950 521 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FAM53BQ14153 422 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TRAM2Q15035 370 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GPR19Q15760 415 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CA13Q8N1Q1 262 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SLC38A4Q969I6 547 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TCTN2Q96GX1 697 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 COG8Q96MW5 612 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CA14Q9ULX7 337 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 WDR45Q9Y484 360 aa6.99□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SNTNA6NMZ2 147 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CLCA1A8K7I4 914 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 J3KTA2 159 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TLR4O00206 839 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CYR61O00622 381 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 AP3D1O14617 1153 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PCDH17O14917 1159 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 AQP9O43315 295 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ZNF749O43361 778 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 B4GAT1O43505 415 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 KIAA0513O60268 411 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PCDHGA12O60330 932 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 STX11O75558 287 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 STATHP02808 62 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 MT-ND2P03891 347 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CDK1P06493 297 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SLC35E2P0CK97 266 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GABRB1P18505 474 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 CHMP24386 653 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GALNSP34059 522 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 LSSP48449 732 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 NXPH1P58417 271 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TAS2R41P59536 307 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 SHC2P98077 582 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GUCA2AQ02747 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 TFF2Q03403 129 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 DUSP2Q05923 314 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 DUSP8Q13202 625 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GAS6Q14393 721 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 NPTX1Q15818 432 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FHL5Q5TD97 284 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 GPR107Q5VW38 600 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 C12orf73Q69YU5 71 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-204ENST00000524843 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms