RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SENP1Q9P0U3 644 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC6A5Q9Y345 797 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDZD2O15018 2839 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2orf72A6NCS6 295 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRG2CA6NGY1 282 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ICOSLGO75144 302 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGT2B11O75310 529 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REM1O75628 298 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSX1P28360 303 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GSTM5P46439 218 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJB13P59910 316 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERP27Q96DN0 273 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIMP4Q99727 224 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHRRA9YTQ3 701 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TO15178 435 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NME6O75414 186 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGFBP2P18065 325 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT4P19013 534 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIPR1Q53HC9 387 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM81Q6P7N7 255 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLYBLQ8N0X4 340 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMBIM1Q969X1 311 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMCO6Q96DC7 493 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL21A1Q96P44 957 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GALNT9Q9HCQ5 603 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIEF1Q9NQG6 463 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OXSMQ9NWU1 459 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMK2AQ9UQM7 478 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDCP20711 480 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPN6P29350 595 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT20P35900 424 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP10-9P60411 292 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNTA1Q13424 505 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PM20D2Q8IYS1 436 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTBD9Q96Q07 612 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCCC2Q9HCC0 563 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLDC2A0PJX2 215 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR6C70A6NIJ9 312 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPB2A8KAH6 182 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERN1O75460 977 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UROSP10746 265 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPN3P20807 821 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CORO7P57737 925 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEBPEQ15744 281 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPB2Q16082 182 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VASNQ6EMK4 673 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTNG2Q96CW9 530 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADOQ96SZ5 270 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERHLQ9NQF3 203 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAS2R9Q9NYW1 312 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MID2Q9UJV3 735 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNPHO15079 494 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLOD3O60568 738 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCB7O75027 752 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPPINO95925 133 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A8P0DMV1 189 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A9P0DMV2 189 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BMP7P18075 431 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL12BP29460 328 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCKP35557 465 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTGDSP41222 190 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A2Q5DJT8 189 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIPMQ5VYY2 423 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM71E1Q6IPT2 247 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOXRED1Q6NXP6 359 aa21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms