RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 NAGLUP54802 743 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SLC18A2Q05940 514 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TRABD2AQ86V40 505 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 LINC01560Q8TB33 94 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 HGDQ93099 445 aa18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 A8MT66 165 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SNPHO15079 494 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ACTL6AO96019 429 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TAC1P20366 129 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NT5EP21589 574 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SOX18P35713 384 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MGAT2Q10469 447 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TOMM20Q15388 145 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MMP21Q8N119 569 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 OR1J4Q8NGS1 313 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PHF21BQ96EK2 531 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NTMT1Q9BV86 223 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MKS1Q9NXB0 559 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CES1P1Q9UKY3 287 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 EMCNQ9ULC0 261 aa18.13■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 COPEO14579 308 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 KLK1P06870 262 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TRAF3Q13114 568 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RCAN2Q14206 197 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 KRT71Q3SY84 523 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CCDC153Q494R4 210 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FBXW10Q5XX13 1052 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FRG2Q64ET8 278 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 DESI1Q6ICB0 168 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PAGE2Q7Z2X7 111 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NUP54Q7Z3B4 507 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 VWA5B2Q8N398 1253 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 METTL4Q8N3J2 472 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZIM3Q96PE6 472 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FRG2BQ96QU4 278 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NODALQ96S42 347 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ITPAQ9BY32 194 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 METTL7AQ9H8H3 244 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 AHSPQ9NZD4 102 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZNF639Q9UID6 485 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 GRID1Q9ULK0 1009 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CFL2Q9Y281 166 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CLCA1A8K7I4 914 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ATP1B1P05026 303 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CPN1P15169 458 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CCNG1P51959 295 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MAP4K2Q12851 820 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SNTA1Q13424 505 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 KEAP1Q14145 624 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NNATQ16517 81 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CROCCP2Q86T23 111 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 WFDC11Q8NEX6 87 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 OMA1Q96E52 524 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 APOPT1Q96IL0 206 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 OR2B2Q9GZK3 357 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PCTPQ9UKL6 214 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 C1orf226A1L170 272 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 DLX3O60479 287 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PLIN3O60664 434 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ICOSLGO75144 302 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PROCP04070 461 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 HRGP04196 525 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CYP4B1P13584 511 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 FOXF2Q12947 444 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms