RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC25Q86WR0 208 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FBF1Q8TES7 1133 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 HGDQ93099 445 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 DOCK7Q96N67 2140 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR78Q96P69 363 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK15Q96Q40 435 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINI1Q99574 410 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ITPAQ9BY32 194 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 REG4Q9BYZ8 158 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 IPPKQ9H8X2 491 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 EHD3Q9NZN3 535 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC189A1A4V9 331 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 H0Y3Z8 333 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR7A17O14581 309 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCB7O75027 752 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ICOSLGO75144 302 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CDH16O75309 829 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 UGT2B11O75310 529 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RCBTB2O95199 551 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN9O95484 217 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NAGAP17050 411 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GCKP35557 465 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPOXP36551 454 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEA4P43358 317 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PLTPP55058 493 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SRYQ05066 204 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MROH9Q5TGP6 573 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FRG2Q64ET8 278 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM111BQ6SJ93 734 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WNT2BQ93097 391 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OMA1Q96E52 524 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FRG2BQ96QU4 278 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NODALQ96S42 347 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TM9SF2Q99805 663 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF14Q9UBS8 474 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCA1O95477 2261 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.041e-10■■■■□ 23.8
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A096LPK6 155 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOX3O15254 700 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL2O95198 593 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CBX7O95931 251 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP1B1P05026 303 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 STARP49675 285 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 LHX2P50458 406 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CCNG1P51959 295 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MAPK12P53778 367 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GFRA1P56159 465 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GUCY2DQ02846 1103 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 DUSP2Q05923 314 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP4K2Q12851 820 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAF3Q13114 568 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SNTA1Q13424 505 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ACAP2Q15057 778 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TRADDQ15628 312 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.53□□□□□ -1.04
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