RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428289.1

AC243772.2-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC243772.2, Length 3,543 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC243772.2-201ENST00000428289 ADAM23O75077 832 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 TNFRSF21O75509 655 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CTSBP07858 339 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 RHCEP18577 417 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SDHBP21912 280 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CRYBA2P53672 197 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 LAS2Q8IYD9 372 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 OR2L5Q8NG80 312 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 HDAC8Q9BY41 377 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 DPH1Q9BZG8 443 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 H0YGG7 62 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CTDSP2O14595 271 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CTSVO60911 334 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CHRM4P08173 479 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 BMP7P18075 431 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CELP19835 753 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GZMMP51124 257 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PDX1P52945 283 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 DPTQ07507 201 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GBX1Q14549 363 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 IFT27Q9BW83 186 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 TEX12Q9BXU0 123 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ZNF576Q9H609 170 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 COL6A3P12111 3177 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 KIAA0513O60268 411 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PIP5K1CO60331 668 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CSF2P04141 144 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FHP07954 510 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CCDC159P0C7I6 412 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 IFI30P13284 250 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PSMA3P25788 255 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SOX6P35712 828 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 KCNAB1Q14722 419 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SMU1Q2TAY7 513 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 C22orf42Q6IC83 251 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 OR7D2Q96RA2 312 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 TM9SF2Q99805 663 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FOXQ1Q9C009 403 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ASIC5Q9NY37 505 aa11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 NBASA2RRP1 2371 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PEX12O00623 359 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 IDUAP35475 653 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 AHRP35869 848 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PROX2Q3B8N5 592 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 USP51Q70EK9 711 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 PLPP6Q8IY26 295 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GPR32P1Q8NGA4 272 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 RDH12Q96NR8 316 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CLCA1A8K7I4 914 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FAM25AB3EWG3 89 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FAM25CB3EWG5 89 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FAM25GB3EWG6 89 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ALOX5P09917 674 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 FCARP24071 287 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 GGT2P36268 569 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 CD300CQ08708 224 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 RPA4Q13156 261 aa11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
AC243772.2-201ENST00000428289 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms