RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC25Q86WR0 208 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P3H2Q8IVL5 708 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH11Q8TC12 318 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF592Q92610 1267 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRG2BQ96QU4 278 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHSPQ9NZD4 102 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF639Q9UID6 485 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLLPQ9Y342 182 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A096LPK6 155 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MXE2 369 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLOD2O00469 737 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCRTR2O43614 444 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFSF13O75888 250 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL2O95198 593 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBX7O95931 251 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRD5A2P31213 254 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEA4P43358 317 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARP49675 285 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNG1P51959 295 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK12P53778 367 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH9Q5TGP6 573 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLC3Q6P597 504 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AAGABQ6PD74 315 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL4Q8N3J2 472 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR78Q96P69 363 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP5K1AQ99755 562 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRODH2Q9UF12 536 aa11.95□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PNV4 684 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMX2A2RU54 273 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRG2CA6NGY1 282 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TO15178 435 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMPD2O60906 423 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCY1B2O75343 617 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G6DO95868 133 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF708P17019 499 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLTPP55058 493 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN18P56856 261 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGCS1Q01581 520 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP2Q05923 314 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT88Q13099 833 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF3Q13114 568 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT8Q8WV74 236 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGTQ969N2 578 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMBIM1Q969X1 311 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL29Q96CT2 875 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO6Q96DC7 493 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFXN2Q96NB2 322 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTMT1Q9BV86 223 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DKKL1Q9UK85 242 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.94□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C70A6NIJ9 312 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C1Q1 480 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSTNO14793 375 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIAH2O43255 324 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGM6O95932 706 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRD5P21918 477 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPICP45877 212 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMDP50402 254 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB8P50452 374 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAV1Q03135 178 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf54Q08AI8 447 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTB4RQ15722 352 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF21BQ96EK2 531 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35A4Q96G79 324 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms