RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-CO3P00414 261 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF8Q02556 426 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL4Q11206 333 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RPA4Q13156 261 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A8Q8N695 610 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YIV9 168 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZW10O43264 779 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO2B1O94956 709 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA14P01570 189 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTM1P09488 218 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMP1P11279 417 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR3P46089 330 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBA2P53672 197 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42P60953 191 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GDPD3Q7L5L3 318 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17RDQ8NFM7 739 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK6Q9HC98 313 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 STSP08842 583 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RSC1A1Q92681 617 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 D6RAR5 112 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PIPP12273 146 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIN4Q56A73 249 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GRHL2Q6ISB3 625 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RASGRP3Q8IV61 690 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX18Q96RF0 628 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51E2Q9H255 320 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR83Q9NYM4 423 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM229AB2RXF0 380 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CCRL2O00421 344 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNKO75909 580 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGA2P52926 109 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PNLIPRP1P54315 467 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1CAP62136 330 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.552e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM92BQ6ZTR7 304 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A2Q9BRI3 323 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ASF1AQ9Y294 204 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF4O60810 478 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PTHP01270 115 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SPNP16150 400 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC15A1P46059 708 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IDH2P48735 452 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 LGI4Q8N135 537 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP19Q96LK0 163 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF221Q9UK13 617 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2RP11717 2491 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRR3A8MPY1 467 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CSO75390 466 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B17O75795 530 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GRK5P34947 590 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIBQ01892 262 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT33BQ14525 404 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPOQ9BU64 300 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TPK1Q9H3S4 243 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 XKR8Q9H6D3 395 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CLN6Q9NWW5 311 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRA5A6NI73 299 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPBD1B2RD01 187 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN7O94888 489 aa24.73■■□□□ 1.55
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