RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB18Q96M61 343 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR52B2Q96RD2 323 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 AIG1Q9NVV5 245 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 G3V3Y1 287 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ACOX3O15254 700 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SCN2BO60939 215 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EDN3P14138 238 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PIGAP37287 484 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K8P41279 467 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FOXO1Q12778 655 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ATCAYQ86WG3 371 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR2M7Q8NG81 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HGDQ93099 445 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 MAGED4Q96JG8 741 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRB8 838 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PPM1BO75688 479 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NAGAP17050 411 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 IL12AP29459 219 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 RFC3P40938 356 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NRG3P56975 720 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TMEM198Q66K66 360 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OMA1Q96E52 524 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DUSP26Q9BV47 211 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DPY30Q9C005 99 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 COQ9O75208 318 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GLSO94925 669 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DNASE1L1P49184 302 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 UFM1P61960 85 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA2Q15349 733 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NATD1Q8N6N6 113 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM13CQ8NE31 585 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TESCQ96BS2 214 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 BAHCC1Q9P281 2608 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ATP8B1O43520 1251 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN2O60636 221 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B11O75310 529 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 C6orf47O95873 294 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 P04436 131 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GPC1P35052 558 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 KCNC4Q03721 635 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 GAB1Q13480 694 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PGS1Q32NB8 556 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 BICRALQ6AI39 1079 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SLC34A3Q8N130 599 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NUP43Q8NFH3 380 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TMBIM1Q969X1 311 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CLMPQ9H6B4 373 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CNIH4Q9P003 139 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 CAPN14A8MX76 684 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 EMC8O43402 210 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 TGDSO95455 350 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 DDX5P17844 614 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 PTGDSP41222 190 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 IDH3AP50213 366 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-201ENST00000236273 NME5P56597 212 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms