RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A30Q5SVS4 291 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 LCTLQ6UWM7 567 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 MARCH9Q86YJ5 346 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SOSTQ9BQB4 213 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM43Q9BTV4 400 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 LHX9Q9NQ69 397 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CNIH4Q9P003 139 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 TEKT2Q9UIF3 430 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CD8B2A6NJW9 211 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PRODHO43272 600 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CD8BP10966 210 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 HOXD10P28358 340 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 EVX1P49640 407 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SMSP52788 366 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CLDN20P56880 219 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 C17orf64Q86WR6 236 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 MORN4Q8NDC4 146 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 DUSP18Q8NEJ0 188 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SAP130Q9H0E3 1048 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 MYO10Q9HD67 2058 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PRKAG1P54619 331 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 RAB40BQ12829 278 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 TEAD2Q15562 447 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CD300LDQ6UXZ3 194 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 LIX1LQ8IVB5 337 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 CLIP3Q96DZ5 547 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PROM1O43490 865 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PSMB5P28074 263 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf57Q0VDD7 668 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 TIGD3Q6B0B8 471 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf94Q6P1W5 598 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ANKK1Q8NFD2 765 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 NEIL3Q8TAT5 605 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 NIPAL2Q9H841 368 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 H7BY64 318 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SPINT1O43278 529 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ALPPL2P10696 532 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ACADMP11310 421 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 RAD51AP1Q96B01 352 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 MED30Q96HR3 178 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SLC35G5Q96KT7 338 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PRAP1Q96NZ9 151 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SLC23A1Q9UHI7 598 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PQ72 361 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 FRS3O43559 492 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 TDP1Q9NUW8 608 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 MAFFQ9ULX9 164 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM149A-201ENST00000227065 PPM1DO15297 605 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 UQCRC1P31930 480 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 FRKP42685 505 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 DEFB103AP81534 67 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFA9Q16795 377 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 SIX5Q8N196 739 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 FAM109AQ8N4B1 249 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 RHBGQ9H310 441 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.45■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 PAPLNO95428 1278 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 C11orf96Q7Z7L8 435 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 SLC37A3Q8NCC5 494 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 TEX47Q8TBZ9 253 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 NUS1Q96E22 293 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 MARVELD1Q9BSK0 173 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 IL20RAQ9UHF4 553 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1B0GVC2 190 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 A6NIN4 97 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 GABRPO00591 440 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 PTNP21246 168 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 SLC1A3P43003 542 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 SLC27A4Q6P1M0 643 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 OR2L2Q8NH16 312 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 AIF1LQ9BQI0 150 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 OR52A5Q9H2C5 316 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 DPEP2Q9H4A9 486 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa25.43■■□□□ 1.66
FAM149A-201ENST00000227065 TBX19O60806 448 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms