RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000106653.3

Usp47-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene Usp47, Length 5,540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47-201ENSMUST00000106653 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Lrr1D3YY91 422 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Opn1mwO35599 359 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ube2q1Q7TSS2 422 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Carnmt1Q80UY1 400 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Chst2Q80WV3 530 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Flrt2Q8BLU0 660 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 MylipQ8BM54 445 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tmem252Q8C353 183 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1469Q8VFW5 309 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 AspdhQ9DCQ2 287 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Trpv4Q9EPK8 871 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ank1Q02357 1862 aa15.95■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm8220F6YKI2 213 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Dnajb5O89114 348 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tm9sf2P58021 662 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Snx33Q4VAA7 574 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ccm2lQ8VCC6 481 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Sec23bQ9D662 767 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 PmpcaQ9DC61 524 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Vmn1r52Q9EP79 309 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Praf2Q9JIG8 178 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mageh1Q9NWG9 218 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm19965J3QNY8 723 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 AmbnO55189 407 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Pde12Q3TIU4 608 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr814Q7TRH4 310 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Abhd18Q8C1A9 464 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Adhfe1Q8R0N6 465 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Riok2Q9CQS5 547 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Otub2Q9CQX0 234 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Pmm1O35621 262 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Chrm4P32211 479 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Defa14P50712 85 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 GlaP51569 419 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gabarapl2P60521 117 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 AktipQ64362 292 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Kyat3Q71RI9 455 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 JamlQ80UL9 379 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Vmn1r189Q8K3N3 312 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Elovl6Q920L5 267 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 PrelpQ9JK53 378 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Fut2Q9JL27 347 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Actc1P68033 377 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Acta1P68134 377 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm45902Q3UDN3 361 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 MagixQ4KL35 324 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Kat7Q5SVQ0 613 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Pon3Q62087 354 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ston2Q8BZ60 895 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ndufb2Q9CPU2 105 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cers4Q9D6J1 393 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Twsg1Q9EP52 222 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ate1Q9Z2A5 516 aa15.94■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm21904A8HG57 180 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm21866J3QMH4 180 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 CfpP11680 464 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ctla2bP12400 113 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Clec3bP43025 202 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Shc4Q6S5L9 626 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Med26Q7TN02 588 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rnf222Q8CEF8 211 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cml2Q8CHQ9 238 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 MrgpreQ91ZB7 310 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olig2Q9EQW6 323 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Plch1Q4KWH5 1682 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1032A2ATE5 310 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm8973D3YX71 104 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr190K7N5T5 307 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cyp17a1P27786 507 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Opa3Q505D7 179 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Fam3cQ91VU0 227 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 MrgprhQ99MT8 321 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Aldoart2A6ZI47 364 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Vmn2r8L7N472 848 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gstm6O35660 218 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cdh3P10287 822 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ankub1Q3UUE9 192 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1318Q7TQW6 320 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1317Q8VF84 316 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Brinp1Q920P3 760 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Myf6P15375 242 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Il13P20109 131 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rab8bP61028 207 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ttf1Q62187 859 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1197Q7TR13 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1196Q7TR14 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms