RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	HGD	Q93099	445 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	MARK4	Q96L34	752 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	OPTC	Q9UBM4	332 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.84	□□□□□ -0.19
IFT20-216	ENST00000588477	GBA	P04062	536 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	NAGA	P17050	411 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	NT5E	P21589	574 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	UGT2B10	P36537	528 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	KCNJ5	P48544	419 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PCYT1A	P49585	367 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CLDN18	P56856	261 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SNTA1	Q13424	505 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TNK1	Q13470	666 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OMA1	Q96E52	524 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13.83	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ABCA1	O95477	2261 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477		K7EPI3	171 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	HCRTR2	O43614	444 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CRH	P06850	196 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	STMN1	P16949	149 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF708	P17019	499 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	S1PR1	P21453	382 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CNTF	P26441	200 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CCKAR	P32238	428 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	GMPR	P36959	345 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	XK	P51811	444 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ARL4C	P56559	192 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SIRPA	P78324	504 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.82	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	C16orf97	H3BN30	126 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	UGT2B11	O75310	529 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SUPT3H	O75486	399 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PAX1	P15863	534 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SRD5A2	P31213	254 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	ATP5J2	P56134	94 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PHEX	P78562	749 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	NUDT13	Q86X67	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.81	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IFT20-216	ENST00000588477	UBXN8	O00124	270 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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