RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546455.5

PCED1B-202, Transcript of PC-esterase domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCED1B, Length 2,328 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1B-202ENST00000546455 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PIK3R3Q92569 461 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ASB4Q9Y574 426 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 A0A075B6Q4 140 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 A0A087WUU8 490 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 HYKKA2RU49 373 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ASNA1O43681 348 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DRD2P14416 443 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RORCP51449 518 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DEFA1P59665 94 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DEFA3P59666 94 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 MLC1Q15049 377 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PDGFRLQ15198 375 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 LTB4RQ15722 352 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CST6Q15828 149 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 SLC9A6Q92581 669 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 WBP1LQ9NX94 342 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 SSR3Q9UNL2 185 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 V9GYH0 126 aa14.64□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 AP3D1O14617 1153 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 KAT7O95251 611 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RAB36O95755 333 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CD79BP40259 229 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 MC3RP41968 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CHRNEQ04844 493 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 BAK1Q16611 211 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 BBS10Q8TAM1 723 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 KAT2AQ92830 837 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PRRC1Q96M27 445 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 OR2A14Q96R47 310 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CERS4Q9HA82 394 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 SIAEQ9HAT2 523 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TIGARQ9NQ88 270 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CH25HO95992 272 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 PKLRP30613 574 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 GJA4P35212 333 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RCVRNP35243 200 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 CDK5Q00535 292 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ZIC1Q15915 447 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ZNF79Q15937 498 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 C2orf27AQ580R0 203 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TRIM69Q86WT6 500 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TM9SF4Q92544 642 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 NELL2Q99435 816 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 MARCH7Q9H992 704 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.63□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 APOA1P02647 267 aa14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TIE1P35590 1138 aa14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 AVPR1BP47901 424 aa14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TAS2R41P59536 307 aa14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 TAB1Q15750 504 aa14.62□□□□□ -0.07
PCED1B-202ENST00000546455 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms