RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541586.5

CCM2-218, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCM2, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-218ENST00000541586 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 TPST1O60507 370 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 LIPCP11150 499 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 MATN1P21941 496 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 AQP1P29972 269 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 XCR1P46094 333 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SLC13A2Q13183 592 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 DSG2Q14126 1118 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 TRIP10Q15642 601 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 NKG7Q16617 165 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 ZNF628Q5EBL2 1059 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 COX15Q7KZN9 410 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 DTX1Q86Y01 620 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 PRSS58Q8IYP2 241 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 RAB8BQ92930 207 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OR51I1Q9H343 314 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 NTMQ9P121 344 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 C9J4A7 227 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CTNSO60931 367 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SOX18P35713 384 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 FOXL2P58012 376 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 A4GALTQ9NPC4 353 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CTSFQ9UBX1 484 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 FRYQ5TBA9 3013 aa25.94■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CLDN4O14493 209 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SLC35E2P0CK97 266 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 RAP2AP10114 183 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 MAGEA8P43361 318 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OCA2Q04671 838 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CHRNB3Q05901 458 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 HMBOX1Q6NT76 420 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OR5D16Q8NGK9 328 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CT55Q8WUE5 264 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 PTGFRNQ9P2B2 879 aa25.93■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 TGFBR3LH3BV60 316 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 C1QTNF9P0C862 333 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OR12D1P0DN82 309 aa25.92■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 AMIGO2Q86SJ2 522 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 OR2L13Q8N349 312 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 MIPOL1Q8TD10 442 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 SLC47A1Q96FL8 570 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.92■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 YIPF4Q9BSR8 244 aa25.92■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 ZNF682O95780 498 aa25.91■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 GIMAP5Q96F15 307 aa25.91■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 RPS6KA6Q9UK32 745 aa25.91■■□□□ 1.74
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CCM2-218ENST00000541586 OR2W5A6NFC9 320 aa25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 TFPTP0C1Z6 253 aa25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 FASP25445 335 aa25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 STX4Q12846 297 aa25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 MYBPC3Q14896 1274 aa25.91■■□□□ 1.74
CCM2-218ENST00000541586 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa25.91■■□□□ 1.74
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