RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR38Q5JTN6 314 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 LEG1Q6P5S2 330 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1328Q86T90 577 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 NFE4Q86UQ8 179 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PHC2Q8IXK0 858 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM123Q8N131 208 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 NANPQ8TBE9 248 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 HMCESQ96FZ2 354 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPNS2Q96L46 248 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RIT2Q99578 217 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 APOOQ9BUR5 198 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SIX2Q9NPC8 291 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 EMCNQ9ULC0 261 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 AFF2P51816 1311 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5H15A6NDH6 313 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAC2D3DTV9 90 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRTM2O43300 516 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 DUX1O43812 170 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TPST2O60704 377 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ANXA3P12429 323 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPGP40121 348 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTP40126 519 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 FNTAP49354 379 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G16P53816 162 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RAG2P55895 527 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.575e-7■■□□□ 13.8
RABGGTB-209ENST00000473406 PCK2Q16822 640 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC43Q8N309 656 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T11Q8NH01 316 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM3CQ92520 227 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROG1Q92886 237 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ZG16BQ96DA0 208 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TGM7Q96PF1 710 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CPXM1Q96SM3 734 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PINK1Q9BXM7 581 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOJQ9H4E5 214 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SUN2Q9UH99 717 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 IFT52Q9Y366 437 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CD8B2A6NJW9 211 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MU76 341 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 BTN3A3O00478 584 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SURF4O15260 269 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CIDEAO60543 219 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SCGNO76038 276 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 FHP07954 510 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TPSB2P20231 275 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 MX1P20591 662 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 LAP3P28838 519 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CD38P28907 300 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 XGP55808 180 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC61GP60059 68 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 LTBQ06643 244 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 RBBP4Q09028 425 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPP2Q13822 863 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TPSAB1Q15661 275 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL7AQ4VC05 210 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 NEPROQ6NW34 567 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SERINC5Q86VE9 423 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM17Q86X19 198 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms