RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MREGQ8N565 214 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVC2 190 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ESPNB1AK53 854 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC28A1O00337 649 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCKAP5O14513 1909 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEC22BO75396 215 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPM1BO75688 479 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRPH2P23942 346 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HTR1EP28566 365 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPICP45877 212 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAN2A2P49641 1150 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA0040Q15053 153 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KANK2Q63ZY3 851 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DESI1Q6ICB0 168 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC34A3Q8N130 599 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2T11Q8NH01 316 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERP27Q96DN0 273 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OMA1Q96E52 524 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF597Q96LX8 424 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RILPQ96NA2 401 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BBS4Q96RK4 519 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LDAHQ9H6V9 325 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR14I1A6ND48 311 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM233B4DJY2 109 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AQP7O14520 342 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACOX3O15254 700 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGS14O43566 566 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUSD5O60279 629 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPHS1O60500 1241 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HCN1O60741 890 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLDN14O95500 239 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAGAP17050 411 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DRD5P21918 477 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPIP34949 423 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASP3P42574 277 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCAF7P61962 342 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GXYLT1Q4G148 440 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM198Q66K66 360 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZSR9 355 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR7G2Q8NG99 324 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EXO5Q9H790 373 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf109Q9NX04 203 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SENP1Q9P0U3 644 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC13O75165 2243 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NINQ8N4C6 2090 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITPR2Q14571 2701 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRG2CA6NGY1 282 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCKDKO14874 412 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TO15178 435 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TYROBPO43914 113 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLOD3O60568 738 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX4O95219 450 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHEK2O96017 543 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC00032P0C843 101 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEFHP12036 1026 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TACR1P25103 407 aa14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms