RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 GLTPD2A6NH11 291 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RAB3BP20337 219 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 C12orf42Q96LP6 360 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SEC14L2O76054 403 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CSF2P04141 144 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PNMTP11086 282 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CDH15P55291 814 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CCNJQ5T5M9 372 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 AWAT2Q6E213 333 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TPRA1Q86W33 373 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CDH20Q9HBT6 801 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GLTPQ9NZD2 209 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.38□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A6NCN8 305 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 H3BSA7 217 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CLN5O75503 358 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PTTG1O95997 202 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RAB8AP61006 207 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FUT2Q10981 343 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HYAL2Q12891 473 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NPRL3Q12980 569 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MEF2DQ14814 521 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PIM3Q86V86 326 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NELL2Q99435 816 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CERS4Q9HA82 394 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FZD1Q9UP38 647 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SOCS2O14508 198 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 INPPL1O15357 1258 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 LDB2O43679 373 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PRAMEF2O60811 474 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMEM63AO94886 807 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 APOC3P02656 99 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PRSS3P35030 304 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HTD2P86397 168 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 EMC10Q5UCC4 262 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CES4AQ5XG92 561 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SCML4Q8N228 414 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 BEST4Q8NFU0 473 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TAAR8Q969N4 342 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SCML1Q9UN30 329 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ARGFXA6NJG6 315 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GPR137BO60478 399 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DDCP20711 480 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ADH7P40394 386 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CD97P48960 835 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GDF10P55107 478 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DGKZQ13574 1117 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GRM7Q14831 915 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PCLAFQ15004 111 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MAL2Q969L2 176 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NID2Q14112 1375 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 AKR1C4P17516 323 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 KCNAB2Q13303 367 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RELL1Q8IUW5 271 aa6.37□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMEM139Q8IV31 216 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms