RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 AVPR1BP47901 424 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 LIMS1P48059 325 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 MAPK10P53779 464 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 MGAT2Q10469 447 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PEX11GQ96HA9 241 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TFAP2AP05549 437 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ATP6V1B1P15313 513 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ARL4DP49703 201 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SEPHS1P49903 392 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 MICAQ29983 383 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SLC9A6Q92581 669 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 H3BMH7 237 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 UGT2B11O75310 529 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 GADD45GO95257 159 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 LINGO3P0C6S8 592 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 IL1RL1Q01638 556 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CHRNEQ04844 493 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 IL18R1Q13478 541 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RNF220Q5VTB9 566 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 OR4D11Q8NGI4 311 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SAP25Q8TEE9 199 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CDS1Q92903 461 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PINK1Q9BXM7 581 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.73■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 A8MVJ9 347 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 H0YIG0 161 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 FFAR1O14842 300 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PCDHGA12O60330 932 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CTNSO60931 367 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 CT62P0C5K7 136 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ACP2P11117 423 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SLC13A2Q13183 592 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 DUSP5Q16690 384 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 HLA-BQ31612 363 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 COMTD1Q86VU5 262 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 D2HGDHQ8N465 521 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 DOK4Q8TEW6 326 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 FEVQ99581 238 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ING2Q9H160 280 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.72■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 BCKDKO14874 412 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 OR10H2O60403 315 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SEMA7AO75326 666 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 OR2B3O76000 313 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 LGI1O95970 557 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ANXA8P13928 327 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 HPCAP84074 193 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SYT16Q17RD7 645 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 COLEC12Q5KU26 742 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF691Q5VV52 312 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 LACC1Q8IV20 430 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 OR4C6Q8NH72 309 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PSD2Q9BQI7 771 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PIGUQ9H490 435 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 EPPINO95925 133 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 ALPPP05187 535 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PNLIPP16233 465 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 RPS6KA3P51812 740 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 PDX1P52945 283 aa22.71■■□□□ 1.23
SERF1B-201ENST00000380750 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms