RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 PINK1Q9BXM7 581 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR51B5Q9H339 312 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 HHATLQ9HCP6 504 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 INIPQ9NRY2 104 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MSRAQ9UJ68 235 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CCL26Q9Y258 94 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 INSL6Q9Y581 213 aa7.36□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 A0A0A6YYD5 115 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 FAM172BPA6NC97 362 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 METTL12A8MUP2 240 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 HMGN4O00479 90 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CCL16O15467 120 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 NDUFS4O43181 175 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CHST10O43529 356 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 NR2F6P10588 404 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 C6P13671 934 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ALDH4A1P30038 563 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SOAT1P35610 550 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 GSSP48637 474 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 DEFB103AP81534 67 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF91Q05481 1191 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SCN1BQ07699 218 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TGM3Q08188 693 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 GPR50Q13585 617 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 PDGFRLQ15198 375 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CEBPEQ15744 281 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 RAB30Q15771 203 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SSX1Q16384 188 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 DUSP7Q16829 419 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 PLK5Q496M5 336 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 XKRXQ6PP77 449 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 FGF11Q92914 225 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 RFKQ969G6 155 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TMEM19Q96HH6 336 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CENPOQ9BU64 300 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MENTQ9BUN1 341 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR2AG1Q9H205 316 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR51E2Q9H255 320 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 NTMQ9P121 344 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ASF1AQ9Y294 204 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ASB4Q9Y574 426 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CDH23Q9H251 3354 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MYL12BO14950 172 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 PRODHO43272 600 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TBX1O43435 398 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 SH3BP5O60239 455 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OR10H3O60404 316 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 HCN1O60741 890 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ENTPD6O75354 484 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 HLA-DQB1P01920 261 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 C1QCP02747 245 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 OPN1SWP03999 348 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 FHP07954 510 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 ACP2P11117 423 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 MYL12AP19105 171 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 TNFSF8P32971 234 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 GRK5P34947 590 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 DDOSTP39656 456 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CASP3P42574 277 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-201ENST00000265616 CRYBB2P43320 205 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms