RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	SMS	P52788	366 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNJ8	Q15842	424 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO43	Q4G163	708 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	AMER3	Q8N944	861 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CRELD1	Q96HD1	420 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MND1	Q9BWT6	205 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MCUB	Q9NWR8	336 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMD9	O00233	223 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLITRK5	O94991	958 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXW4	P57775	412 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ANGPT1	Q15389	498 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PLD2	O14939	933 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PGRMC2	O15173	223 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	AQP9	O43315	295 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OSM	P13725	252 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PVR	P15151	417 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GRPR	P30550	384 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL4D	P49703	201 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GBX1	Q14549	363 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HERVK_113	Q902F9	699 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NELL2	Q99435	816 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MED20	Q9H944	212 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	KMO	O15229	486 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HCN1	O60741	890 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CA3	P07451	260 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	DDC	P20711	480 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CD72	P21854	359 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PIK3R3	Q92569	461 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ACER3	Q9NUN7	267 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SSX4	O60224	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	TMPRSS11D	O60235	418 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	B4GALT2	O60909	372 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HLA-DQA2	P01906	255 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ARAF	P10398	606 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OR56A3	Q8NH54	315 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CHFR	Q96EP1	664 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	KNTC1	P50748	2209 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	LDB3	O75112	727 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GCGR	P47871	477 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CHRNE	Q04844	493 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	STX4	Q12846	297 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GNA13	Q14344	377 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX7	Q9UNH6	387 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48

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