RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ACTL6AO96019 429 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4B1P13584 511 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GFAPP14136 432 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT15P19012 456 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GPX3P22352 226 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX18P35713 384 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PAFAH1B1P43034 410 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SLCO1A2P46721 670 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NEK2P51955 445 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2H2Q13888 395 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 27.4
EFTUD2-226ENST00000593200 PFKFB4Q16877 469 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 DACH2Q96NX9 599 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 DPH5Q9H2P9 285 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT8Q9NY28 637 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ACOT9Q9Y305 439 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 MED12LQ86YW9 2145 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM187AA6NFU0 413 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SNPHO15079 494 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1BO75688 479 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 RCBTB2O95199 551 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 INHBBP09529 407 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CPN1P15169 458 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NAGAP17050 411 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 S1PR1P21453 382 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5EP21589 574 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 STX2P32856 288 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGDSP41222 190 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3CGP48736 1102 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 XKP51811 444 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 IRF9Q00978 393 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXF2Q12947 444 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 POU4F3Q15319 338 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 LUZP2Q86TE4 346 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 FBF1Q8TES7 1133 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SMPDL3BQ92485 455 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 HGDQ93099 445 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ISL2Q96A47 359 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 UCN2Q96RP3 112 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINI1Q99574 410 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 TM9SF2Q99805 663 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ERP44Q9BS26 406 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 IPPKQ9H8X2 491 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF14Q9UBS8 474 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087X1B8 175 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3D21A4FU49 640 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 H0Y3Z8 333 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ICOSLGO75144 302 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 C2P06681 752 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CPMP14384 443 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GCKP35557 465 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CPA2P48052 419 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 GNG11P61952 73 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SNTA1Q13424 505 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NAB1Q13506 487 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ACAP2Q15057 778 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 NNATQ16517 81 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SHEQ5VZ18 495 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms