RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 OR5M3Q8NGP4 307 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ACPTQ9BZG2 426 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 BRINP2Q9C0B6 783 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ZFP64Q9NPA5 681 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MCM8Q9UJA3 840 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 EMCNQ9ULC0 261 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GVC2 190 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM23A6NLE4 172 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 BCKDKO14874 412 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 PCDH7O60245 1069 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 PROCP04070 461 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ATP1B1P05026 303 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CELA3AP09093 270 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MAN2A2P49641 1150 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 NAA20P61599 178 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MAP4K2Q12851 820 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 SLC10A1Q14973 349 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 RPS6KA2Q15349 733 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CDSNQ15517 529 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 SPIN4Q56A73 249 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 EMC4Q5J8M3 183 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 TBCELQ5QJ74 424 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM64Q6YI46 380 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 C17orf47Q8NEP4 570 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 DIO2Q92813 273 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ADIPOR1Q96A54 375 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 KCNA7Q96RP8 456 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 DOHHQ9BU89 302 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 LDAHQ9H6V9 325 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 EXO5Q9H790 373 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 PFDN4Q9NQP4 134 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 CFL2Q9Y281 166 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 TIMM22Q9Y584 194 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 HRH3Q9Y5N1 445 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 LRBAP50851 2863 aa13.27□□□□□ -0.28
CMTM3-215ENST00000568477 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FOXO6A8MYZ6 492 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 G3V2L1 256 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 AQP7O14520 342 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SUSD5O60279 629 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LRATO95237 230 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 IL3P08700 152 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PRF1P14222 555 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DRD2P14416 443 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 S1PR1P21453 382 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GPX3P22352 226 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CRHR1P34998 444 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PTGER4P35408 488 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CCT5P48643 541 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FBXW4P57775 412 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RPP38P78345 283 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HMGCS1Q01581 520 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MGAT2Q10469 447 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC153Q494R4 210 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GXYLT1Q4G148 440 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM111BQ6SJ93 734 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ASB5Q8WWX0 329 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF597Q96LX8 424 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PROK2Q9HC23 129 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRD33BA6NCL7 494 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 COPEO14579 308 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PLIN3O60664 434 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HCN1O60741 890 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CRCPO75575 148 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACVR2AP27037 513 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms