RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PPARD	Q03181	441 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LTB	Q06643	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SGCG	Q13326	291 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NFATC2	Q13469	925 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RASA2	Q15283	850 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDKL2	Q92772	493 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NDN	Q99608	321 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE1	Q99829	537 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934		A6NCN8	305 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934		H3BQF6	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LAT	O43561	262 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDH16	O75309	829 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PCCB	P05166	539 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	C2	P06681	752 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ITGB6	P18564	788 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SAT1	P21673	171 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM23	P36406	574 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PTGER3	P43115	390 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEA9	P43362	315 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CD151	P48509	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TTPA	P49638	278 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	THBS3	P49746	956 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CTSC	P53634	463 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LIMK2	P53671	638 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDKN2D	P55273	166 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R39	P59534	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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