RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TCEAL3Q969E4 200 aa8.09□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GNB5O14775 395 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SPARCP09486 303 aa8.08□□□□□ -1.12
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