RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 PRR22Q8IZ63 422 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 SMPDL3BQ92485 455 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 REPS1Q96D71 796 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 MTHFD2P13995 350 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 TM9SF2Q99805 663 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 SYCE1LA8MT33 242 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 UGDHO60701 494 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 P3H2Q8IVL5 708 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-210ENST00000527027 ZANQ9Y493 2812 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC189A1A4V9 331 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 C2orf72A6NCS6 295 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 H0Y3Z8 333 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRU-210ENST00000527027 GFAPP14136 432 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 CPMP14384 443 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 CHMP24386 653 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 PTGDSP41222 190 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 PAFAH1B1P43034 410 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 DIO3P55073 304 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 GPX6P59796 221 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 CALCOCO2Q13137 446 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-210ENST00000527027 GAB1Q13480 694 aa14.64□□□□□ -0.07
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