RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514640.5

ZBED3-AS1-214, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED3-AS1, Length 1,300 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TLR4O00206 839 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 B3GALT2O43825 422 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PLOD3O60568 738 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IFNW1P05000 195 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ATP1B1P05026 303 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MSL3P1P0C860 447 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IGFBP5P24593 272 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SOAT1P35610 550 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ALDH9A1P49189 494 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 DAPP51397 102 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CRISP3P54108 245 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NXPH1P58417 271 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SMIM11AP58511 58 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZP2Q05996 745 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BIKQ13323 160 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TUBA3CQ13748 450 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SPIDRQ14159 915 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NR1D2Q14995 579 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CEP68Q76N32 757 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 KRT73Q86Y46 540 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 OR2L13Q8N349 312 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CYGBQ8WWM9 190 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TANKQ92844 425 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ELP4Q96EB1 424 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TMEM19Q96HH6 336 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SLC6A18Q96N87 628 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MUS81Q96NY9 551 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PIP5K1AQ99755 562 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 EXD2Q9NVH0 621 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SATB2Q9UPW6 733 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SPACA6W5XKT8 324 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.56□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GSAPA4D1B5 854 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FAM170BA6NMN3 283 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 C5orf58C9J3I9 102 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 H0YGG7 62 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CYR61O00622 381 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PGRMC2O15173 223 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 P2RX6O15547 441 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 AK1P00568 194 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ADAP00813 363 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 WNT1P04628 370 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CRHBPP24387 322 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GALNSP34059 522 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PIGAP37287 484 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MAP3K8P41279 467 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GABRA4P48169 554 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LSSP48449 732 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IST1P53990 364 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LIM2P55344 173 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HSPB3Q12988 150 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FAM53BQ14153 422 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MICAQ29983 383 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NADK2Q4G0N4 442 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TMEM31Q5JXX7 168 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RNF220Q5VTB9 566 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF773Q6PK81 442 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 C11orf74Q86VG3 221 aa7.55□□□□□ -1.2
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms