RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494667.5

PRKD3-210, Transcript of protein kinase D3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKD3, Length 4,326 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3-210ENST00000494667 SSTR2P30874 369 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 PIK3CGP48736 1102 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 FNTBP49356 437 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 SELENOPP49908 381 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 HNMTP50135 292 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 WNT3P56703 355 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 WNT3AP56704 352 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRKD3-210ENST00000494667 SLC14A1Q13336 389 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRKD3-210ENST00000494667 C22orf42Q6IC83 251 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.55□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRKD3-210ENST00000494667 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRKD3-210ENST00000494667 GALPQ9UBC7 116 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRKD3-210ENST00000494667 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 FGF16O43320 207 aa4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 LANCL1O43813 399 aa4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 HLA-DPB1P04440 258 aa4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 MGMTP16455 207 aa4.54□□□□□ -1.68
PRKD3-210ENST00000494667 S100A3P33764 101 aa4.54□□□□□ -1.68
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