RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	LPAL2	Q16609	132 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PCK2	Q16822	640 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF130	Q86XS8	419 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MLKL	Q8NB16	471 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MCHR2	Q969V1	340 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CPXM1	Q96SM3	734 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ATF6B	Q99941	703 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	VGLL1	Q99990	258 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RAB17	Q9H0T7	212 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	DCTPP1	Q9H773	170 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ACTR8	Q9H981	624 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ABCC8	Q09428	1581 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GOLGA3	Q08378	1498 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ATP8B3	O60423	1300 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	AFF2	P51816	1311 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A0J9YWU9	116 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A0U1RQV5	110 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF222	A6NCQ9	220 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		F8WDY8	70 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PDHX	O00330	501 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CRLF1	O75462	422 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RALA	P11233	206 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GP9	P14770	177 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	UCP1	P25874	307 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP2R1A	P30153	589 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OXTR	P30559	389 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC1A4	P43007	532 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NUMB	P49757	651 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	NME3	Q13232	169 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	EMC2	Q15006	297 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	DDI2	Q5TDH0	399 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	MOB2	Q70IA6	237 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CERS5	Q8N5B7	392 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BCORP1	Q8N888	145 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	BIRC7	Q96CA5	298 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RAB3C	Q96E17	227 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	OR4F4	Q96R69	305 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ECT2	Q9H8V3	914 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	JPT2	Q9H910	190 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	GNB4	Q9HAV0	340 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RARRES3	Q9UL19	164 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ABCC4	O15439	1325 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF212B	A8MTL3	300 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		H3BMH7	237 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036		K7EPI3	171 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM208A-208	ENST00000487036	PDXK	O00764	312 aa		2.53	□□□□□ -2

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