RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GON7Q9BXV9 100 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 WWP1Q9H0M0 922 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 C1orf21Q9H246 121 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GANQ9H2C0 597 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PELI2Q9HAT8 420 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LY9Q9HBG7 655 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 HMG20AQ9NP66 347 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 DIABLOQ9NR28 239 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MBD2Q9UBB5 411 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF221Q9UK13 617 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP50Q9UKX7 468 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MYO5BQ9ULV0 1848 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NID2Q14112 1375 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 IGSF1Q8N6C5 1336 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PPM1 405 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MAGEB16A2A368 324 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 A8MZ25 164 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM25AB3EWG3 89 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM25CB3EWG5 89 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM25GB3EWG6 89 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 H0Y626 953 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 H0YJX3 145 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF197O14709 1029 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 BET1O15155 118 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TM9SF1O15321 606 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKAB2O43741 272 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SPOPO43791 374 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA3DO95025 777 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NGFP01138 241 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 IL1BP01584 269 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MT-ND3P03897 115 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RB1P06400 928 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PGK2P07205 417 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ASNSP08243 561 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMP2P13473 410 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CCNA2P20248 432 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GCAP28676 217 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 HCAR3P49019 387 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ETV1P50549 477 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PTK6Q13882 451 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT33BQ14525 404 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 HERC3Q15034 1050 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CNSTQ6PJW8 725 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 KBTBD6Q86V97 674 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GPBP1Q86WP2 473 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CARM1Q86X55 608 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CLYBLQ8N0X4 340 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PARP8Q8N3A8 854 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX31Q8N9S9 440 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MTERF3Q96E29 417 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CNDP1Q96KN2 507 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MYADMQ96S97 322 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNK16Q96T55 309 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CDRT15Q96T59 188 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PKP2Q99959 881 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms