RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 UGT2B11O75310 529 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GADD45GO95257 159 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 LIMS1P48059 325 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 OR2L13Q8N349 312 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ASNA1O43681 348 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GPR75O95800 540 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GNA13Q14344 377 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 LAIR2Q6ISS4 152 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TCTN3Q6NUS6 607 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A45Q8N413 288 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35A4Q96G79 324 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CHST10O43529 356 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 BMP10O95393 424 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 EPPINO95925 133 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FNTBP49356 437 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HMGA2P52926 109 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RAB38P57729 211 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DEF8Q6ZN54 512 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS15Q8TE58 950 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 KCND3Q9UK17 655 aa21.33■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SCN2AQ99250 2005 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JPF8 293 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 M0R3H8 397 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ETS2P15036 469 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 AGXTP21549 392 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 GABRA4P48169 554 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH3B2P48448 385 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 IL5RAQ01344 420 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNEQ04844 493 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 IL18R1Q13478 541 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.32■■□□□ 1
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A1Q9H2H9 487 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.32■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FOXS1O43638 330 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ATP1B1P05026 303 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MYF5P13349 255 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NT5EP21589 574 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RYKP34925 604 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HLCSP50747 726 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 OR1D5P58170 312 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NPRL3Q12980 569 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 KEAP1Q14145 624 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A6Q92581 669 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 TANKQ92844 425 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZG16BQ96DA0 208 aa21.31■■□□□ 1
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VSTM4-201ENST00000298454 GIN1Q9NXP7 522 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.31■■□□□ 1
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VSTM4-201ENST00000298454 CRHBPP24387 322 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FHL5Q5TD97 284 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CDC73Q6P1J9 531 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.31■■□□□ 1
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VSTM4-201ENST00000298454 CDS1Q92903 461 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 AASSQ9UDR5 926 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.31■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 COLEC12Q5KU26 742 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SGCDQ92629 289 aa21.3■■□□□ 1
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