RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 SPRED3Q2MJR0 410 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 GK5Q6ZS86 529 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 SLC22A16Q86VW1 577 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 TMEM251Q8N6I4 163 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 OR52B6Q8NGF0 335 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 DOK4Q8TEW6 326 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 UCN3Q969E3 161 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 SDCCAG3Q96C92 435 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 FBXL20Q96IG2 436 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 CDK15Q96Q40 435 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 SPOCK3Q9BQ16 436 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 MECRQ9BV79 373 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 IL1RL2Q9HB29 575 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 ZBTB26Q9HCK0 441 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 TMEM216Q9P0N5 145 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 LIPGQ9Y5X9 500 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 ZNF407Q9C0G0 2248 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-210ENST00000591412 A0A1B0GVC2 190 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 GLOD5A6NK44 160 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ACOT7O00154 380 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 STX16O14662 325 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 DYRK3O43781 588 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SEMA3DO95025 777 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CLDN9O95484 217 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 AIFM1O95831 613 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PROCP04070 461 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 RBP1P09455 135 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NR2F6P10588 404 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 GALNSP34059 522 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 DNASE1L1P49184 302 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TRAF3Q13114 568 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CHI3L2Q15782 390 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CCDC153Q494R4 210 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TMEM211Q6ICI0 200 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PAOXQ6QHF9 649 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 FAM109AQ8N4B1 249 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 RPRMLQ8N4K4 120 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SLC15A4Q8N697 577 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PHF21BQ96EK2 531 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ART5Q96L15 291 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 LURAP1Q96LR2 239 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NTMT1Q9BV86 223 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ENKD1Q9H0I2 346 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 XPR1Q9UBH6 696 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PCTPQ9UKL6 214 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TGDSO95455 350 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 GBAP04062 536 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 P04436 131 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SLC35E2P0CK97 266 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 COL6A2P12110 1019 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ALDH3A1P30838 453 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PIGAP37287 484 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 MAGEA5P43359 124 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SLC37A1P57057 533 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 HERVK_113P63132 956 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ERVK-8P63133 956 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 BST1Q10588 318 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 STX3Q13277 289 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 EBPQ15125 230 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 GXYLT1Q4G148 440 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CYP20A1Q6UW02 462 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TRILQ7L0X0 811 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NUDT13Q86X67 352 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TMEM151AQ8N4L1 468 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ZNF441Q8N8Z8 693 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SLC22A8Q8TCC7 542 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PAQR8Q8TEZ7 354 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 C10orf82Q8WW14 230 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 RIT1Q92963 219 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SERPINI1Q99574 410 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 ERVK-6Q9BXR3 956 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PROK2Q9HC23 129 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 NPHS2Q9NP85 383 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 PNPLA3Q9NST1 481 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 COQ3Q9NZJ6 369 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-210ENST00000591412 TMCO1Q9UM00 188 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms