RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 PBX4Q9BYU1 374 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SDCBP2Q9H190 292 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.03□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CD109Q6YHK3 1445 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A087X1B8 175 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM196BA6NMK8 535 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 AP1G1O43747 822 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TULP3O75386 442 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SPDEFO95238 335 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ACTL6AO96019 429 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PLATP00750 562 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SYPP08247 313 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ACSM4P0C7M7 580 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ARAFP10398 606 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TYRP1P17643 537 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MCAMP43121 646 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PLA2G16P53816 162 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 DAOAP59103 153 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJB13P59910 316 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 UBE2G1P62253 170 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GABREP78334 506 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZXDAP98168 799 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LTB4RQ15722 352 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 G2E3Q7L622 706 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAM1L1Q8N609 369 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NATD1Q8N6N6 113 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SFXN5Q8TD22 340 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NTAN1Q96AB6 310 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CMKLR1Q99788 373 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LXNQ9BS40 222 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MANBALQ9NQG1 85 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GDF3Q9NR23 364 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.03□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF521Q96K83 1311 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CD300LBA8K4G0 201 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 F8W036 122 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 M0QYV0 167 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR2T1O43869 369 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR10H3O60404 316 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TBX19O60806 448 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PDE8BO95263 885 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SYNGR4O95473 234 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MT-ATP6P00846 226 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ITGB2P05107 769 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HMGN1P05114 100 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PFKMP08237 780 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MGMTP16455 207 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SOX18P35713 384 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CCR2P41597 374 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CASP3P42574 277 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MTNR1BP49286 362 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PRDX4Q13162 271 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP2K5Q13163 448 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LAPTM4AQ15012 233 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NSDHLQ15738 373 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC36A2Q495M3 483 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 THEM4Q5T1C6 240 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CORO6Q6QEF8 472 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINA11Q86U17 422 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.02□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NT5C3BQ969T7 300 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms