RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OBSL1	O75147	1896 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CCL24	O00175	119 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		O00370	1275 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	EXTL3	O43909	919 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NGF	P01138	241 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MT-ND3	P03897	115 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CEBPB	P17676	345 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FCAR	P24071	287 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA3	P26006	1051 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ARL2	P36404	184 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEB1	P43366	347 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NAMPT	P43490	491 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GLIPR1	P48060	266 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1024L	P59773	190 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SMARCB1	Q12824	385 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RPS6KA1	Q15418	735 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ACKR1	Q16570	336 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LPAL2	Q16609	132 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KYAT1	Q16773	422 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	VIT	Q6UXI7	678 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PIGZ	Q86VD9	579 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SIAH3	Q8IW03	269 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ING5	Q8WYH8	240 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CPB2	Q96IY4	423 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	IFT74	Q96LB3	600 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PANX3	Q96QZ0	392 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	EDEM2	Q9BV94	578 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	THAP9	Q9H5L6	903 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	HES2	Q9Y543	173 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	STK36	Q9NRP7	1315 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ACACA	Q13085	2346 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FAM149A	A5PLN7	773 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		H0YCG3	227 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KLF11	O14901	512 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PGRMC2	O15173	223 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GLRA3	O75311	464 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC22A3	O75751	556 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	REC8	O95072	547 aa		3.64	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms