RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 DNASE1P24855 282 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 WNT3P56703 355 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 BICRALQ6AI39 1079 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 OR52E8Q6IFG1 317 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM64Q6YI46 380 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CAMKMTQ7Z624 323 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 WDR41Q9HAD4 459 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 JKAMPQ9P055 326 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa27.62■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 HMX2A2RU54 273 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 RAD51CO43502 376 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 SEMA3DO95025 777 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CT62P0C5K7 136 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 FOSL1P15407 271 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CASP3P42574 277 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PHEXP78562 749 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GUCY2DQ02846 1103 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.018e-6■□□□□ 8.7
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM81Q6P7N7 255 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CYP20A1Q6UW02 462 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PAMR1Q6UXH9 720 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 NUDT13Q86X67 352 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 FBF1Q8TES7 1133 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 KCTD4Q8WVF5 259 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 HSPBAP1Q96EW2 488 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM41AQ96HV5 264 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GPR78Q96P69 363 aa27.61■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC14BA6NHZ5 514 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 IL2RAP01589 272 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TMED10P49755 219 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PPP2R2AP63151 447 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 IRF9Q00978 393 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 ACAP2Q15057 778 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PFKFB4Q16877 469 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA4Q8NEY3 305 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 WDYHV1Q96HA8 205 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GNRHR2Q96P88 292 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PRM3Q9NNZ6 103 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 A0A087X1B8 175 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 ACSL3O95573 720 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 C2P06681 752 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 EPXP11678 715 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 BMP7P18075 431 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 S1PR1P21453 382 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 STX2P32856 288 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 ADAM8P78325 824 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 SORDQ00796 357 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2H2Q13888 395 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GALNT12Q8IXK2 581 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 UGT2B28Q9BY64 529 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 OR10A5Q9H207 317 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 IPPKQ9H8X2 491 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 CALHM2Q9HA72 323 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 RNF11Q9Y3C5 154 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 GOSR1O95249 250 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 IL18BPO95998 194 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TACR1P25103 407 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN6P29350 595 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEA4P43358 317 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 NEK2P51955 445 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 FAM83EQ2M2I3 478 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 DCST1Q5T197 706 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 PACS2Q86VP3 889 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 OR7G1Q8NGA0 311 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO25Q8TCJ0 367 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 SLC6A5Q9Y345 797 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-202ENST00000505490 TRAPPC6AO75865 159 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NAGAP17050 411 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PIK3CGP48736 1102 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CAV1Q03135 178 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TIGD3Q6B0B8 471 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ZDHHC24Q6UX98 284 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 SERPINI1Q99574 410 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ADAM29Q9UKF5 820 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CDH16O75309 829 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL2O95198 593 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ATE1O95260 518 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 GBAP04062 536 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 GFAPP14136 432 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 GPX3P22352 226 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CTSSP25774 331 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PIK3R1P27986 724 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ABCD3P28288 659 aa27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms