RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCHQ86VS3 1027 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SPARTQ8N0X7 666 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LGI4Q8N135 537 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CADM4Q8NFZ8 388 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4D11Q8NGI4 311 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 BBS10Q8TAM1 723 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf58Q96GQ5 468 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 FEVQ99581 238 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBA1CQ9BQE3 449 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 FUZQ9BT04 418 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP21Q9H596 190 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 UCK1Q9HA47 277 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LYRM4Q9HD34 91 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT84Q9NSB2 600 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 RLIMQ9NVW2 624 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ACAD8Q9UKU7 415 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 POMT2Q9UKY4 750 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PSME2Q9UL46 239 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 DAPP1Q9UN19 280 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNE3Q9Y6H6 103 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM186AA6NE01 2351 aa10.15□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JPF8 293 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC1A7O00341 560 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDH17O14917 1159 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ASNA1O43681 348 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 B3GALT2O43825 422 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC28A2O43868 658 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINB7O75635 380 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 EPPINO95925 133 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRM4P08173 479 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ALPPL2P10696 532 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ETS2P15036 469 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 CPN2P22792 545 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC5A2P31639 672 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TTKP33981 857 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGER1P34995 402 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ESRRGP62508 458 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SPIBQ01892 262 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB134Q4QY38 66 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 XAF1Q6GPH4 301 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM107Q6UX40 140 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR141Q7Z602 305 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 COMTD1Q86VU5 262 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 OOSP2Q86WS3 158 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM46DQ8NEK8 389 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP43Q8NFH3 380 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 OR9A2Q8NGT5 310 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SGCDQ92629 289 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 COL21A1Q96P44 957 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF607Q96SK3 696 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 CSF3RQ99062 836 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 NELL2Q99435 816 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 WFDC6Q9BQY6 131 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SEMA6CQ9H3T2 930 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPC4Q9UBN4 977 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms