RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 A6NCN8 305 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 NEDD8Q15843 81 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 LCN8Q6JVE9 175 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.8□□□□□ -1.16
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