RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-205ENST00000391970 KIF3AQ9Y496 699 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-205ENST00000391970 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM94Q12767 1356 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 A8MXK9 166 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-205ENST00000391970 PDHXO00330 501 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-205ENST00000391970 RASGRF2O14827 1237 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF853P0CG23 659 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 ASMTP46597 345 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 METTL7BQ6UX53 244 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 Q8N377 158 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 ACTR3BQ9P1U1 418 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 IL20RAQ9UHF4 553 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-205ENST00000391970 RARRES3Q9UL19 164 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-205ENST00000391970 SNX1Q13596 522 aa2.53□□□□□ -2
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