RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 LPGAT1Q92604 370 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PTP4A1Q93096 173 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SGK3Q96BR1 496 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC11Q96DB2 347 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CNDP1Q96KN2 507 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TNIP3Q96KP6 325 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CNBD2Q96M20 576 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 EYA3Q99504 573 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 COQ7Q99807 217 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PIGQQ9BRB3 760 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NYXQ9GZU5 481 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NAPBQ9H115 298 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GKN1Q9NS71 199 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARMCX1Q9P291 453 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MBD2Q9UBB5 411 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NARFQ9UHQ1 456 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SARDHQ9UL12 918 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PLLPQ9Y342 182 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ALG6Q9Y672 507 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NHSQ6T4R5 1651 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RICTORQ6R327 1708 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UBE4BO95155 1302 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MROH5Q6ZUA9 1318 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WV62 115 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PRG0 241 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SMCO2A6NFE2 343 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF98A6NK75 572 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PRR32B1ATL7 298 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf81C9J6K1 198 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 H3BMM5 538 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PLK4O00444 970 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SEC14L5O43304 696 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PEX14O75381 377 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DDHD2O94830 711 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PIGNO95427 931 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 WDPCPO95876 746 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IFNA16P05015 189 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G4BP0C869 781 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CYP2A7P20853 494 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CHMP24386 653 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IL12AP29459 219 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HSPA1LP34931 641 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GRIA1P42261 906 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MARCKSL1P49006 195 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DNA2P51530 1060 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BLVRAP53004 296 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LIMK1P53667 647 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CDH15P55291 814 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GPX6P59796 221 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HAND2P61296 217 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 COPZ1P61923 177 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEP78395 509 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UBE3AQ05086 875 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BST1Q10588 318 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CETN1Q12798 172 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 OVGP1Q12889 678 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BNIP2Q12982 314 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PPIL2Q13356 520 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MORF4L2Q15014 288 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PARP15Q460N3 678 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CEP55Q53EZ4 464 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HYIQ5T013 277 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GRTP1Q5TC63 336 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATF7IP2Q5U623 682 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms