RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.96□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GTQ1 180 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DUXAA6NLW8 204 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 A8MVJ9 347 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HCRTR1O43613 425 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DUX1O43812 170 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PLOD3O60568 738 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SDC3O75056 442 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJB6O75190 326 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB7O75635 380 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJB5O75953 348 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 BMP10O95393 424 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ALBP02768 609 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 BCHEP06276 602 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MSL3P1P0C860 447 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR12D1P0DN82 309 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXD12P35452 270 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MC3RP41968 323 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNJ5P48544 419 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HMGA2P52926 109 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 IST1P53990 364 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CRISP3P54108 245 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 RAD23AP54725 363 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MYBPC1Q00872 1141 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SQSTM1Q13501 440 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR19Q15760 415 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PLK5Q496M5 336 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC23Q5W5X9 447 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TSSK4Q6SA08 328 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM107Q6UX40 140 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GALNT10Q86SR1 603 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT73Q86Y46 540 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 KMT5CQ86Y97 462 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 NUP43Q8NFH3 380 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB8BQ92930 207 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GIMAP5Q96F15 307 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TPD52L3Q96J77 140 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CSF3RQ99062 836 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 BTBD2Q9BX70 525 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM117AQ9C073 453 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 VNN3Q9NY84 501 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CALML5Q9NZT1 146 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 C3orf18Q9UK00 162 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.95□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0G2JPF8 293 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PS29 197 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 H0YIG0 161 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SGK494L7N484 410 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC16A6O15403 523 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 B4GAT1O43505 415 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 CHST10O43529 356 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 FOXS1O43638 330 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC28A2O43868 658 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SOX30O94993 753 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SNAP29O95721 258 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 OPN1SWP03999 348 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35E2P0CK97 266 aa8.94□□□□□ -0.98
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms