RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp4f3Q99N16 524 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 9030624G23RikQ9D308 155 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CalyQ9DCA7 226 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Emc7Q9EP72 241 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr44Q9EQB8 314 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sphk2Q9JIA7 617 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mid2Q9QUS6 705 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smok1Q9QYZ4 484 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TesminQ9WTJ6 475 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scnn1gQ9WU39 655 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lhx9Q9WUH2 397 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Upk1bQ9Z2C6 260 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AtmQ62388 3066 aa8.76□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap77A0A087WRI3 283 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp738B8JJX8 793 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6619F6URP1 175 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmb5O55234 264 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 UgdhO70475 493 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mup4P11590 178 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc6a11P31650 627 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 VipP32648 170 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 InaP46660 501 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MazP56671 477 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ube2iP63280 158 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rack1P68040 317 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Six5P70178 719 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hdac2P70288 488 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fgf14P70379 247 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cct3P80318 545 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ica1P97411 478 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc11Q14AK4 347 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prss48Q14B25 312 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fahd2Q3TC72 313 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q3U6N9 222 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alg10bQ3UGP8 474 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmat1Q3V0C1 714 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bcl2a1bQ497M6 172 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taar7bQ5QD11 358 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdh12Q5RJH3 794 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1364Q5SZS9 314 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnh1Q60603 989 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk10Q61831 464 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 KdsrQ6GV12 332 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SpicQ6P3D7 242 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pik3c3Q6PF93 887 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Timd4Q6U7R4 343 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trappc6aQ78XR0 159 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex13c3Q810P0 219 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a12Q8BH59 677 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tyw3Q8BSA9 257 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MetrnQ8C1Q4 291 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Endod1Q8C522 501 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EloaQ8CB77 773 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Galnt18Q8K1B9 622 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtg1Q8R2R6 326 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp709Q8VC29 727 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med25Q8VCB2 745 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgef3Q91X46 524 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem63aQ91YT8 804 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acss1Q99NB1 682 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NarfQ9CYQ7 462 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc52a3Q9D6X5 460 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clic3Q9D7P7 237 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AnkhQ9JHZ2 492 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TrehQ9JLT2 576 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rdh11Q9QYF1 316 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MeltfQ9R0R1 738 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srpk3Q9Z0G2 565 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg2bQ80XK6 2075 aa8.75□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp300A2AE21 645 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mamdc4A2AJA7 1228 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp969A2ART2 485 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp973A2BE20 318 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xlr5aA2BI45 236 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf39A2RT81 352 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pramef20B1ARV6 477 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp992B1ASD8 573 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14862B1AV28 81 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8180E9PXN0 145 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm17175E9Q528 179 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp934K7N6H3 473 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r31L7N2F1 303 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sult2b1O35400 338 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pld3O35405 488 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dll3O88516 592 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prph2P15499 346 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LcatP16301 438 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PahP16331 453 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms