RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Oosp1Q925U0 202 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cmpk1Q9DBP5 196 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TriobpQ99KW3 2014 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr376E9Q4M1 320 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Aldh3b3J3QMK6 479 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PvalbP32848 110 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Obox3Q3UT54 335 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Commd6Q3V4B5 87 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Diras2Q5PR73 199 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nt5eQ61503 576 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm10330Q8BKS1 112 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr96Q8VFE3 313 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bbox1Q924Y0 387 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dhrs1Q99L04 313 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Yipf2Q99LP8 312 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gabra4Q9D6F4 552 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gde1Q9JL56 331 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp981A2A8V7 445 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr543E9PWI5 336 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcpp2E9PYC2 171 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcpp1L7N1X9 171 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fgf18O89101 207 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 H2-EaP01904 255 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 P04224 255 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 SrgnP13609 152 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dppa5bP85965 119 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Serpinb9fQ80UK5 377 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp810Q99K45 461 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ly6kQ9CWP4 154 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eef1e1Q9D1M4 174 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 IqchQ9D2K4 1071 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 CerklA2AQH1 525 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tex264E9Q137 309 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm7970L7N271 213 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm7980L7N471 213 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NlkO54949 527 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pgam2O70250 253 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sec24aQ3U2P1 1090 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pak6Q3ULB5 682 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ostf1Q62422 215 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm5346Q7M766 736 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gpr176Q80WT4 515 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Itih5Q8BJD1 952 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nlrp10Q8CCN1 673 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q8K207 121 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kctd11Q8K485 232 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr826Q8VFU6 313 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr825Q8VFU7 320 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tex13bQ99MW5 186 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cadm3Q99N28 396 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Wdsub1Q9D0I6 474 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HgfacQ9R098 653 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 UxtQ9WTZ0 157 aa12.89□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Capns1O88456 269 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Folr1P35846 255 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Smu1Q3UKJ7 513 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Defb48Q3UW22 87 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bhlhb9Q6PB60 539 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tas2r104Q7M723 302 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcun1d3Q8K0V2 304 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q91V76 315 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ankrd54Q91WK7 299 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrgpra1Q91WW5 304 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NaxdQ9CZ42 343 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sohlh2Q9D489 467 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sertad3Q9ERC3 197 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Praf2Q9JIG8 178 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tinf2Q9QXG9 341 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PbsnO08976 174 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Irf4Q64287 450 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm21627Q810R0 219 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mchr1Q8JZL2 353 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bcl7aQ9CXE2 210 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Plpp6Q9D4F2 292 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cers5Q9D6K9 414 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Orc5Q9WUV0 435 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1247A2AT78 314 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Esp18A8R0V1 91 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccrl2O35457 360 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lingo2Q3URE9 606 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc26a10Q5EBI0 492 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam46cQ5SSF7 391 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q8C3W1 322 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nmral1Q8K2T1 309 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfyve21Q8VCM3 234 aa12.88□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrps18bQ99N84 254 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms