RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 LAX1Q8IWV1 398 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 FGF11Q92914 225 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 RAB8BQ92930 207 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TP53INP1Q96A56 240 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 MED18Q9BUE0 208 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.6□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 HMX3A6NHT5 357 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 KIAA0355O15063 1070 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 IDH3BO43837 385 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC28A2O43868 658 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SH3BP5O60239 455 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 B4GALT2O60909 372 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 CISD3P0C7P0 127 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 GSTM3P21266 225 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 RCVRNP35243 200 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 DGKEP52429 567 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 ST8SIA6P61647 398 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 CDK5Q00535 292 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 REEP5Q00765 189 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TLE2Q04725 743 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 NFE2L1Q14494 772 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 DUSP6Q16828 381 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SYT14P1Q58G82 188 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 RTL10Q7L3V2 364 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 NUDT13Q86X67 352 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TMIEQ8NEW7 156 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TBX21Q9UL17 535 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 ASF1AQ9Y294 204 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.59□□□□□ -0.87
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM129A0AVI4 362 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 PRKYO43930 277 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 RPN2P04844 631 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 C6P13671 934 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 PPP2R1BP30154 601 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 GIPRP48546 466 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC9A3P48764 834 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 CCR8P51685 355 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SMSP52788 366 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 UBE3AQ05086 875 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 HSPB3Q12988 150 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 BAK1Q16611 211 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 PLK5Q496M5 336 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 USP30Q70CQ3 517 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 MRGPREQ86SM8 312 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 BBS10Q8TAM1 723 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 NR4A3Q92570 626 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 RGMAQ96B86 450 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 IL17FQ96PD4 163 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 F2RL3Q96RI0 385 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 NELL2Q99435 816 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC22A4Q9H015 551 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 ABCG4Q9H172 646 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.59□□□□□ -0.88
SAMMSON-218ENST00000641601 LHX9Q9NQ69 397 aa9.59□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms