RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	EHD3	Q9NZN3	535 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PSME2	Q9UL46	239 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	LHX6	Q9UPM6	363 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		7.92	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PQ72	361 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PCDH17	O14917	1159 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD28	O15084	1053 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf47	O95873	294 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PDGFA	P04085	211 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CLPS	P04118	112 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SERPINA7	P05543	415 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CD1E	P15812	388 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PRPS1L1	P21108	318 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DRD4	P21917	467 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GPC1	P35052	558 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SOX18	P35713	384 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MC3R	P41968	323 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	STX1B	P61266	288 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MGAT2	Q10469	447 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DUSP8	Q13202	625 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	LY6D	Q14210	128 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	EXT1	Q16394	746 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	NNAT	Q16517	81 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SZRD1	Q7Z422	152 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD46	Q86W74	232 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	OR7G2	Q8NG99	324 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	M1AP	Q8TC57	530 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF721	Q8TF20	911 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	C10orf82	Q8WW14	230 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	TTC9	Q92623	222 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	VMP1	Q96GC9	406 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	NPAS2	Q99743	824 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DUSP26	Q9BV47	211 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	LHPP	Q9H008	270 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MGA	Q8IWI9	3026 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PRB8	838 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GMNC	A6NCL1	334 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	WWP2	O00308	870 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	NR5A2	O00482	541 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CFLAR	O15519	480 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	DYRK3	O43781	588 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	TBX19	O60806	448 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CBX7	O95931	251 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ATP1B1	P05026	303 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	IDO1	P14902	403 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GPX3	P22352	226 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	S100A3	P33764	101 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SOAT1	P35610	550 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CLCN2	P51788	898 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GPR143	P51810	404 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	WNT3	P56703	355 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	PHC1	P78364	1004 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	GSTA3	Q16772	222 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	AGK	Q53H12	422 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPL4-208	ENST00000564744	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		7.9	□□□□□ -1.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms