RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 ODF4Q2M2E3 257 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 FUT11Q495W5 492 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 EOGTQ5NDL2 527 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 NUP54Q7Z3B4 507 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 NUDT13Q86X67 352 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CDK20Q8IZL9 346 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 EID3Q8N140 333 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 LEMD2Q8NC56 503 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KCTD6Q8NC69 237 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ARSGQ96EG1 525 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ART5Q96L15 291 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM20AQ96MK3 541 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 GCNT4Q9P109 453 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ESPL1Q14674 2120 aa4.58□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TRAPPC3O43617 180 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CSO75390 466 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 DFFBO76075 338 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ZFAND5O76080 213 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KRT7P08729 469 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 GNSP15586 552 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CDC25CP30307 473 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PTGER4P35408 488 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CAPZA2P47755 286 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PGFP49763 221 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TPMTP51580 245 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PPP5CP53041 499 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PPARDQ03181 441 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 SQLEQ14534 574 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CASC1Q6TDU7 716 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 Q6ZSR9 355 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM25Q86YD3 366 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF611Q8N823 705 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 THAP8Q8NA92 274 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TCP11Q8WWU5 503 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ATL1Q8WXF7 558 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 DYRK2Q92630 601 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 WBP1Q96G27 269 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 RIT2Q99578 217 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 STUB1Q9UNE7 303 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CPQQ9Y646 472 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.57□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TACC2O95359 2948 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MSGN1A6NI15 193 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 UBE2CO00762 179 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 SLITRK3O94933 977 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF883P0CG24 379 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 CDH3P22223 829 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KRT20P35900 424 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 GCNT1Q02742 428 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 RALGDSQ12967 914 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TFDP1Q14186 410 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 HERC3Q15034 1050 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 LCE1FQ5T754 118 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 WSCD1Q658N2 575 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 IQCHQ86VS3 1027 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 BBS7Q8IWZ6 715 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 MMD2Q8IY49 270 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.56□□□□□ -1.68
AC009396.1-201ENST00000553628 BMPERQ8N8U9 685 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms