RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	RND1	Q92730	232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	QRFPR	Q96P65	431 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	KCNC2	Q96PR1	638 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-231	ENST00000552222	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	INAFM1	C9JVW0	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SGK494	L7N484	410 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	AZIN1	O14977	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ITM2A	O43736	263 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CRCP	O75575	148 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NEFH	P12036	1026 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HSD3B1	P14060	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CHN1	P15882	459 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HSD3B2	P26439	372 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SERPINB3	P29508	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ARFIP1	P53367	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SKP1	P63208	163 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	BTN3A2	P78410	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TGM3	Q08188	693 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ASB5	Q8WWX0	329 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RGMA	Q96B86	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	FAR2	Q96K12	515 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SERPINI1	Q99574	410 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	COL6A5	A8TX70	2615 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222		A0A088AWK7	358 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JN53	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PLPP1	O14494	284 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	KLF11	O14901	512 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	DNAJB6	O75190	326 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RDH16	O75452	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SEMA3D	O95025	777 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ATE1	O95260	518 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HSPA4L	O95757	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HOXC12	P31275	282 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SLC1A6	P48664	564 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	BST1	Q10588	318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	KANK2	Q63ZY3	851 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HBEGF	Q99075	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SORT1	Q99523	831 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ACPT	Q9BZG2	426 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HAO1	Q9UJM8	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36

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