RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GLOD5A6NK44 160 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 IDSB3KWA1 339 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PLOD2O00469 737 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FGF17O60258 216 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SCN2BO60939 215 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SOX30O94993 753 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 KCNH1O95259 989 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CAPN3P20807 821 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PPIBP23284 216 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PTPN4P29074 926 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 FOLR3P41439 243 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 STT3AP46977 705 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 WNT3P56703 355 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MAP4K2Q12851 820 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SSPNQ14714 243 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TLR1Q15399 786 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NSDHLQ15738 373 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 VPS26BQ4G0F5 336 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZNF385BQ569K4 471 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TMEM205Q6UW68 189 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TMEM64Q6YI46 380 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GK5Q6ZS86 529 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 SNX32Q86XE0 403 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TREML1Q86YW5 311 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TMEM52Q8NDY8 209 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ZNF675Q8TD23 568 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CT55Q8WUE5 264 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 NKD1Q969G9 470 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 DGAT2Q96PD7 388 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PHF12Q96QT6 1004 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 CRB3Q9BUF7 120 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 ADAP2Q9NPF8 381 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 PTGFRNQ9P2B2 879 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 C3orf18Q9UK00 162 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 GMEB1Q9Y692 573 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-211ENST00000488243 BSNQ9UPA5 3926 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WV62 115 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 A0A096LPI6 279 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQ72 361 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RFXANKO14593 260 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR10H2O60403 315 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LDB3O75112 727 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ALOX12BO75342 701 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 KRT34O76011 436 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 KRT16P08779 473 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MMP11P24347 488 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DGKQP52824 942 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PHC1P78364 1004 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CLN3Q13286 438 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DNASE1L3Q13609 305 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ERV3-1Q14264 604 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MPEG1Q2M385 716 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LCN10Q6JVE6 187 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MMP21Q8N119 569 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 EXD3Q8N9H8 876 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SFXN5Q8TD22 340 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 GTF2H4Q92759 462 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 VPS33AQ96AX1 596 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PANX1Q96RD7 426 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SH3GL1Q99961 368 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C1orf21Q9H246 121 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NTMQ9P121 344 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TCFL5Q9UL49 500 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 VPS4AQ9UN37 437 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CORO2BQ9UQ03 480 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms