RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 HSD11B2P80365 405 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PNCKQ6P2M8 343 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PAQR7Q86WK9 346 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MSANTD3Q96H12 275 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF559Q9BR84 538 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 UGDHO60701 494 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGEF15O94989 841 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CSNK1DP48730 415 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ARG2P78540 354 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TUBB3Q13509 450 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RDH12Q96NR8 316 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ABCB7O75027 752 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF28P17035 718 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GCGRP47871 477 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SOX9P48436 509 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HPS1Q92902 700 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SFXN2Q96NB2 322 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HIDE1A8MVS5 230 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TBX10O75333 385 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM17P78536 824 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 EDAQ92838 391 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC42Q9Y546 428 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FLRT2O43155 660 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RAD51DO75771 328 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR4D1Q15615 310 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TSC22D1Q15714 1073 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LCTLQ6UWM7 567 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GPR26Q8NDV2 337 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DDIT4LQ96D03 193 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RTP4Q96DX8 246 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MKLN1Q9UL63 735 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ATE1O95260 518 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA3CQ13748 450 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RNF220Q5VTB9 566 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DOK4Q8TEW6 326 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PKP2Q99959 881 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SARDHQ9UL12 918 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0G2JPF8 293 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 H3BSH0 61 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HTR1EP28566 365 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SLC6A11P48066 632 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TOR1BO14657 336 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FMO6PO60774 539 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CPNE6O95741 557 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TIMP2P16035 220 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF43P17038 809 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RHCEP18577 417 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 IL4RP24394 825 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLCN2P51788 898 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SRYQ05066 204 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ST3GAL4Q11206 333 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RAB6CQ53S08 254 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IGHEP01854 428 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ERVFC1P60507 584 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 YPEL5P62699 121 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NFATC4Q14934 902 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms