RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SLC10A3P09131 477 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA3P12429 323 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ADRB3P13945 408 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 C5AR1P21730 350 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SPATS1Q496A3 300 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 DPP6P42658 865 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF367Q7RTV3 350 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC46Q96FV0 321 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 NEDD4LQ96PU5 975 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PITX2Q99697 317 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MAS1P04201 325 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RPA4Q13156 261 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SPAG16Q8N0X2 631 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 NANSQ9NR45 359 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 POU3F4P49335 361 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CDNFQ49AH0 187 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KLBQ86Z14 1044 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LMO3Q8TAP4 145 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RDH8Q9NYR8 311 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CCRL2O00421 344 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 P04436 131 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CD3GP09693 182 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KCNAB2Q13303 367 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CLCA4Q14CN2 919 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM69Q5SWH9 247 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MTG2Q9H4K7 406 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ATE1O95260 518 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TUBG1P23258 451 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LCN1P31025 176 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP41Q8N8Y5 198 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RFT1Q96AA3 541 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 C5AR2Q9P296 337 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TYROBPO43914 113 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SPINT3P49223 89 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GPR137CQ8N3F9 429 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KCNN1Q92952 543 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RORAP35398 523 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FAM3CQ92520 227 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SHISA4Q96DD7 197 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SEC14L4Q9UDX3 406 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 DLGAP1O14490 977 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FDXRP22570 491 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 BMPR1AP36894 532 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ATAD3CQ5T2N8 411 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf42Q6IC83 251 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF778Q96MU6 729 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 VSTM2BA6NLU5 285 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ENPP6Q6UWR7 440 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 NPWQ8N729 165 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 BORCS6Q96GS4 357 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 H0YJX3 145 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MALLQ13021 153 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TEPSINQ96N21 525 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 IL20RAQ9UHF4 553 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF850A8MQ14 1090 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 EEDO75530 441 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPW3 197 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LEG1Q6P5S2 330 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TREML1Q86YW5 311 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RDH12Q96NR8 316 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 AIG1Q9NVV5 245 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SH3PXD2BA1X283 911 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SSX5O60225 188 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1BO75688 479 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GSTT2P0CG29 244 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ETFAP13804 333 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R38P59533 333 aa21.34■■□□□ 1.01
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